La fase de operación corresponde a aquella en la cual el proyecto ya se encuentra en uso y abierto al público. Esta fase evalúa que los costos de operación y mantención sean acordes a lo presupuestado en la etapa de diseño, así como también, que los usos y las actividades propuestas para el proyecto se desarrollen conforme a lo previsto. Esta evaluación se lleva a cabo luego del primer año de operación del proyecto y permitirá obtener –o no- la categoría HESEP. De igual modo puede identificar mejoras necesarias de introducir para alcanzar la categoría.